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[目的]该研究旨在克隆苦荞中查尔酮合成酶全长基因。[方法]选用乌克兰伊琳娜苦养为试验材料，以从叶片中提取的RNA为模板，应用RACE技术结合CODEHOP引物设计方法克隆苦养中查尔酮合成酶cDNA序列，通过电子合并获得其全长。设计基因全长特异性引物，以DNA为模板进行PCR扩增出基因序列。应用Clustalxl．81和MEGA4软件进行序列分析和进化树的建立；核酸和蛋白质序列同源性分析应用NCBI的Blastn和Blastp完成。[结果性物信息学分析表明，该基因全长1906bp，具有一个463bp的内含子