【摘 要】
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目的 采用生物信息学软件分析细粒棘球绦虫胰岛素受体(EgIR)蛋白的分子特性,并分析其功能.方法 从NCBI蛋白质数据库中下载EgIR的氨基酸序列,采用SignalP 4.1、ProtParam、SMA
【机 构】
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遂宁市中心医院检验科,四川遂宁629000;重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室
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目的 采用生物信息学软件分析细粒棘球绦虫胰岛素受体(EgIR)蛋白的分子特性,并分析其功能.方法 从NCBI蛋白质数据库中下载EgIR的氨基酸序列,采用SignalP 4.1、ProtParam、SMART、NetPhos 3.1等在线分析程序预测EgIR蛋白的信号肽序列、理化性质、保守结构域及磷酸化位点;采用Pairwise Sequence Alignment Tools分析EgIR与其他物种来源IR间的序列一致性;采用MEGA 6.06程序对不同物种来源的IR蛋白进行多序列比对并构建进化树,进行系统分析.结果 EgIR蛋白由1661 aa组成,为一种亲水性的非分泌跨膜蛋白.EgIR蛋白具有TyrKc、FnIII等IR保守的结构域,含有117个丝氨酸磷酸化位点、51个苏氨酸磷酸化位点和16个酪氨酸磷酸化位点.EgIR蛋白的二级结构主要为无规卷曲,占41.06％;三维结构呈倒“V”型.EgIR在近膜区缺少NPXY基序,也不含有YxxxYY基序.EgIR与EmIR2和SjIR1的序列一致性分别为92.9％和35.1％,亲缘关系较近,与人、牛、羊IR的序列一致性分别为27.5％、27.2％和25.3％,亲缘关系较远.结论 EgIR蛋白有与EmIR2和SjIR1相似的功能,参与虫体葡萄糖代谢的调节及生长发育,可作为防治囊性包虫病的药物靶标.
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