地沟油非法生产加工和使用过程的特点决定了在治理中应采取疏堵结合，以疏为主的政策措施。要从地沟油的源头上解决问题。在回收地沟油过程中，无论是政府还是企业，都需要支付给宾馆、餐厅等一定的报酬，由收费改为付费。在激励的同时，增加对餐厅等的监管，对其违法出售废弃油脂的行为依法查处，大幅度增加其违法成本。
　　废弃油脂的回收不管是生物柴油企业自己或者是第三方收购，都应该加强监管，借鉴一些地方成功模式，对运输车辆实行实时监控，防止向非法渠道流出。根据地沟油相关产业的特点，地方政府应该根据当地的具体情况，由政府主导和监管地沟油再利用的所有环节，主要把生物柴油应用到市政公共车辆上。这样既可以保证生物柴油的销售，还可以对地沟油生产、加工和使用的过程进行全方位地监督。
　　生物柴油成本高于传统燃料是短期内的既定事实，对于相关企业的补贴也无法避免，因此需要构建合理的成本分摊机制。首先，地沟油的回收和再利用属于可再生能源行业，国家财政应当予以扶持。其次，地沟油的再回收是城市环境卫生建设中不可或缺的重要部分，地方政府也有不可推卸的责任。地沟油是宾馆、餐厅的废弃物，也应为后期处理付出一定的成本，只是在实际过程中，要改变收费的方式和渠道，不能在回收餐厨废弃物的过程中增加费用，可以增加到其他收费项目上。另外，现在一些城市中有很多餐厨废弃物的回收人员，这些人很多既没有政府的许可，也没有得到应有的监管。政府需要统一规范这些人员，进行资格审查，予以许可后在监督下合法收集。这样既能保证废弃油脂流向合法生产企业，又不至于这些人员铤而走险、非法贩卖废弃油脂。最重要的是，地沟油一旦回流餐桌，将造成庞大的后续健康成本，全国上下需要一致努力应对，尽可能避免这种情况的发生。