【摘 要】
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为探讨正常与低品质中华绒螯蟹的肠道菌群结构差异,采用高通量测序技术,测定细菌16S rDNA V3 V5区基因序列,通过生物信息学方法,分析比较肠道菌群结构和多样性以及可培养菌群
【机 构】
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上海海洋大学水产动物遗传育种中心/上海市协同创新中心,上海海洋大学国家水生动物病原库,上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心
【基金项目】
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上海市中华绒螯蟹产业技术体系建设项目[编号:沪农科(字)产(2018)第4号],水产动物遗传育种上海市协同创新中心项目(编号:ZF1206)
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为探讨正常与低品质中华绒螯蟹的肠道菌群结构差异,采用高通量测序技术,测定细菌16S rDNA V3 V5区基因序列,通过生物信息学方法,分析比较肠道菌群结构和多样性以及可培养菌群结构的特点。结果表明,中华绒螯蟹正常组(NG)肠道中绝对优势菌群为厚壁菌门(93.54%),而其他门的丰度均很低(2.81%以下),其中以厚壁菌门的乳球菌属丰度最高(86.00%);低品质组(LG)以厚壁菌门(62.60%)、变形菌门(22.42%)、拟杆菌门(5.74%)和软壁菌门(5.69%)为主,其中以厚壁菌门的尚无属名的Z
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