【摘 要】
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目的:应用生物信息学分析牙囊干细胞(DFSCs)成骨分化过程中基因调控网络。方法:从GEO Datasets数据库获取在DFSCs成骨分化过程中差异表达的基因。应用DAVID和Gene MANIA数据
【机 构】
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上海市徐汇区大华医院口腔科,上海交通大学医学院附属瑞金医院古北口腔科,复旦大学附属华山医院口腔科
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目的:应用生物信息学分析牙囊干细胞(DFSCs)成骨分化过程中基因调控网络。方法:从GEO Datasets数据库获取在DFSCs成骨分化过程中差异表达的基因。应用DAVID和Gene MANIA数据库对这些基因的关系进行分析。结果:从GEO Datasets数据库获得了大量DFSCs成骨分化过程中差异表达的基因,对差异表达明显(P<0.05)的289个基因进行分析,富集到"细胞分化"、"细胞增殖"、"骨骼系统发育"、"钙信号通路"等基因子集。其中ALPL、CTSK、TUFT1、TGFBR2、FHL2、ROR2、STC1、POSTN,ZBTB16、FRZB、PRELP、IGFBP5等12个基因被富集在"骨骼系统发育"子集,这12个基因通过共表达、共定位、遗传学相互作用等彼此关联并与其它信号通路相联系。结论:DFSCs成骨分化中许多差异表达的基因间存在相互作用的分子网路。需要从WNT、TGFbeta、MAPK等信号通路、同源盒转录因子及成骨分化标记物基因的整体关系上来认识DFSCs成骨分化。
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