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对来自海南、福建、广西、云南、湖南和广东等我国南方6个代表性省(区)的72个水稻纹枯病菌菌株进行了RAPD聚类分析及致病力测定。结果表明,供试菌株存在丰富的遗传多样性。通过使用10个随机引物对该病菌基因组DNA进行PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳,共获得210条DNA谱带,其中5条为特征带,205条为多态带,条带多态率为98%。在0.54左右的相似性系数水平,所有供试菌株被划分为6个类群,所有来自同一省(区)的菌株均聚类为同一类群或亚类群。DNA条带的多态性与地理来源呈现明显的相关性,但与致病力的强弱无明显的相