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根据高场非对称波形离子迁移谱（FAIMS）系统对非对称脉冲电源的要求，提出了一种FAIMS系统用高频高压非对称脉冲电源的设计方案。该方案依托于通用的半桥电路，辅之以Atmega16为核心的PWM生成电路、可靠的栅极驱动及高压功率MOSFET动态静态保护电路。该电源输出非对称方波幅值达2kV，当频率为200kHz，功耗仅为90W。测试结果表明该设计方案实际可行，能满足FAIMS检测系统的工作需求，且具有电路结构简单、频率占空比可调、功耗低等特点。