【摘 要】
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运用RT-PCR方法扩增A/Chicken/Zhejiang/HJ/2007(H9N2)毒株8基因片段,序列比较及遗传进化分析结果表明,所克隆的8个基因片段均有HJ毒株完整的开放阅读框,其血凝素基因(HA)(FJ
【基金项目】
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国家重点基础研究规划(973)项目(NO.2005CB523003)资助
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运用RT-PCR方法扩增A/Chicken/Zhejiang/HJ/2007(H9N2)毒株8基因片段,序列比较及遗传进化分析结果表明,所克隆的8个基因片段均有HJ毒株完整的开放阅读框,其血凝素基因(HA)(FJ581431)蛋白裂解位点的氨基酸组成为-PSKSSR*G-,为不连续的碱性氨基酸,符合低致病性AIVHA基因裂解位点的序列特征;与QA/HK/G1/97的进化关系较近。其神经氨酸酶基因(NA)(FJ581434)在遗传进化上属于常见的CK/BJ/1/94群系。核蛋白基因(NP)(FJ581428)整合有同地分离的H5N1亚型流感病毒NP基因片段,进化关系较近。基质蛋白基因(M)(FJ581432)与1999年香港感染儿童的两株流感病毒在进化关系属于同一分支。非结构蛋白基因(NS)(FJ581433)和1998年首次报道的猪源H9N2亚型流感病毒处在同一进化分支。聚合酶蛋白基因PB1(PB1)(FJ581435)从33～47位存在15个连续碱基缺失,是首次报道该基因ORF内存在缺失,且和聚合酶蛋白基因PA(PA)(FJ581430)在遗传进化上类似,均与近年来分离的H5N1亚型流感病毒处在同一分支;聚合酶蛋白基因PB2(PB2)(FJ581429)与常见的流感病毒毒株的遗传进化关系较远。因此,A/Chicken/Zhejiang/HJ/2007(H9N2)是由不同流感病毒基因亚系间发生自然重排的产物。
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