目的 筛查潜在的小分子量低丰度的HCC血清相关候选蛋白,为肝癌复杂病理机制的全面阐明、理想早期诊断标志物的发现提供新思路.方法 分别收集81例伴有HBV感染和肝硬化背景的HCC患者血清,43例慢性乙型肝炎和36例肝硬化患者血清,采用弱阳离子交换蛋白芯片(WCX2)介质结合SELDI-TOF-MS对患者血清蛋白谱进行检测,并通过Biomarker Wizard软件对生成的蛋白指纹峰分别进行差异归类比较,然后采用消减差异分析确定HCC特异相关候选蛋白.标本检测前,对芯片检测系统的重复性进行分析.结果 同一标本同一芯片内强度CV为17.46%,m/z平均CV为0.024%,不同芯片间强度CV为17.74%,m/z平均CV为0.024%.将信噪比大于5,且超过20%标本具有的蛋白峰认定为有意义峰,在2 000～30 000 m/z范围内,共有128个蛋白指纹峰被确认.HCC与肝硬化患者血清蛋白指纹峰的差异比较分析显示,87个差异蛋白指纹峰有统计学意义(P＜0.05),其中强度差异在2倍以上的蛋白指纹峰有45个,在HCC患者血清中2倍上调的15个,2倍下调的30个.从HCC与慢性乙型肝炎血清蛋白指纹峰的差异分析发现,差异有统计学意义的蛋白指纹峰52个(P＜0.05),其中强度相差2倍以上的蛋白指纹峰有9个,HCC患者血清中2倍上调的2个,2倍下调的7个.从肝硬化与慢性乙型肝炎患者血清蛋白指纹峰的差异比较分析发现,差异有统计学意义的蛋白指纹峰79个(P＜0.05),其中强度相差2倍以上的蛋白指纹峰有28个,在肝硬化患者血清中2倍上调的17个,慢性乙型肝炎患者血清中2倍上调的11个.经消减差异分析筛查,确定在HCC患者血清下调表达的5个公共差异蛋白(2 870、3 941、2 688、3 165、5 483 m/z)及在肝硬化和HCC血清均上调表达的2个公共差异蛋白(3 588、2 017 m/z),但蛋白2 017 m/z在HCC与健康人比较的本所前期工作中的差异无统计学意义(P＞0.05).结论 由慢性乙型肝炎和肝硬化背景产生的非特异分泌蛋白的干扰,经消减分析被部分消除,获得的6个血清公共差异蛋白(2 870、3 941、2 688、3 165、5 483、3 588 m/z)在反映HCC病理特征方面具有明显的特异性,且有望成为HCC诊断中新的候选标志物。