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本文以TPP谈判中国企改革与知识产权保护两个议题为背景,基于企业研发投资结构视角,分析中国企业自主创新能力缺失的原因和提升的必要性.通过分析,发现:一方面,通过同一时期和工业化相同发展阶段企业研发投资结构的国际比较发现,中国企业研发投资结构不合理、基础研究投资占比偏低,这是导致中国企业自主创新能力缺失的重要原因,而其根源在于中国企业发展过程中资源过度财政化下的研发资金错配;另一方面,从企业自主创新能力角度客观分析TPP中国企改革和知识产权保护的议题,这两个议题是对中国企业提升自主创新能力的提示,通过改善中国存在的这两个问题,可以在一定程度上提升企业自主创新的意识和能力.