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简单重复序列（SSR）是进行遗传多样性研究的一种有效分子标记。选用来自国内外的番茄材料共36份，利用番茄的SSR引物进行扩增，采用聚类分析方法对供试材料进行了遗传多样性分析。从400对SSR引物中筛选到24对多态性高、扩增稳定、重复性好的引物，利用NTSYS软件进行聚粪分析结果显示，36份材料被聚成7大类。