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近十年二代测序技术快速发展,与一代测序技术相比具有通量高、速度快、灵敏度高、准确率高等优点,主要以454焦磷酸测序、Illumina测序、Ion Torrent测序和SOLiD测序为代表。二代测序技术在HIV领域的研究已经越来越广泛,本文介绍了上述四种二代测序技术在HIV准种进化方面的应用。