等位基因多态性群体遗传结构的多元非线性分析方法

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长期以来 ,对于多维基因多态性数据的多元统计分析 ,如计算遗传距离时所用的聚类分析、分析群体遗传结构时所用的主成分分析、因子分析和典型相关分析等 ,一直应用为无约束条件数据而设计的经典多元线性分析方法 ,并没有注意基因多态性数据的“闭合效应”所带来的问题。从分析基因多态性数据的分布和结构特征入手 ,文中指出了基因多态性分布具有“闭合数据”的特点 ,分析了由于“闭合效应”的影响 ,经典多元线性方法用于群体遗传结构分析所面临的困难。根据成分数据统计分析的理论和方法 ,提出了基因多态性群体遗传结构的多元非线性分析基本方法。并以主成分分析为例 ,通过实例比较和分析了经典线性主成分分析和“对数比”非线性主成分分析的结果 ,证明“对数比”非线性主成分分析方法是研究基因多态性群体遗传结构的良好方法 ,具有特异、灵敏等优点 ,其结果符合群体遗传学规律
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