【摘 要】
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为阐明油菜miR156基因家族的进化过程以及与靶基因的作用位点,分析了油菜miR156基因家族的序列特征、进化模式和候选靶基因,共获得35个bna-miR156基因,对应44个成熟序列。这
【机 构】
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中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室
【基金项目】
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湖北省自然科学基金(2016CFB286);国家863计划(2013AA102602)
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为阐明油菜miR156基因家族的进化过程以及与靶基因的作用位点,分析了油菜miR156基因家族的序列特征、进化模式和候选靶基因,共获得35个bna-miR156基因,对应44个成熟序列。这些bna-miR156基因分布在油菜的17条染色体上,其中C3染色体上分布着5个bna-miR156基因。bna-miR156基因在产生成熟序列的区域高度保守,而其它位置保守性较低,进化分析结果显示bna-miR156家族可以分为5个分支,家族成员分布较为分散,位于同一条染色体上的bna-miR156基因并没有表现出更近的亲缘关系。另外,系统发育分析结果显示SBP-box基因在双子叶植物油菜、拟南芥中存在相似的进化模式,进一步发现只有部分BnaSBP家族基因拥有bna-miR156的作用位点,其中30个BnaSBP基因的靶位点位于编码区,11个位于3’UTR。一些拥有bna-miR156作用位点的BnaSBP具有组织表达特异性,因此bna-miR156可能与BnaSBP相互作用,调控油菜生长发育过程。
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