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自1994年分税制财政体制实施以来，转移支付制度作为财政体制结构中的重要组成部分，在调节各级政府财政收支，促进区域经济协调等方面发挥着举足轻重的作用。但目前我国的转移支付制度仍然存在着一定的缺陷，改革我国的转移支付制度，应合理划分我国各级政府的财权和事权；规范转移支付的资金分配方法，扩大因素法的使用范围；科学确定政府间转移支付制度的目标；优化转移支付结构，构建纵横交错的转移支付框架；加快转移支付制度的法制化建设，加强转移支付的法律保障；建立转移支付评价、监督和考核机制。