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目的:运用微阵列和生物信息学分析来揭示与甲状腺乳头状癌(PTC)预后不良有关的基因.方法:选取2016年9月～2018年9月期间入住湖南省人民医院乳甲外科并确诊为甲状腺乳头状癌患者的癌组织和对应癌旁组织对进行基因表达谱分析和差异表达基因的筛选;采用DAVID软件对差异基因行GO功能富集分析和信号通路富集(KEGG)分析,采用STRING数据库对筛选出的差异基因进行蛋白互作网络分析;利用TCGA数据库平台,采用Kaplan-Meier分析方法进行生存分析.结果:甲状腺乳头状癌组织中共筛选出差异表达的基因364个,差异表达的LncRNA 228个.GO分析结果显示:甲状腺乳头状癌差异基因在生物过程中主要富集于“负增长调节”.在分子功能中显著富集于“蛋白酶结合”.在细胞组成中,差异基因主要富集在“细胞外小体”.KEGG信号通路分析提示矿物吸收、胃酸分泌及TGF-β信号通路与甲状腺乳头状癌相关.PPI网络显示GAC前15位核心基因.基于TCGA数据库的生存分析发现FN1、SMAD9与甲状腺乳头状癌的预后负相关,SPARC、TGFβR1的表达与PTC预后正相关.结论:FN1、SMAD9、SPARC、TGFβR1可能作为PTC靶向治疗的潜在分子靶点.