结核分枝杆菌Rv3607c T细胞表位分布情况预测及分析

来源 :武汉轻工大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：magic1213cam

【摘要】

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为了预测和分析结核分枝杆菌（MTB）Rv3607c抗原的CD4＋T以及CD8＋T细胞表位的分布状况,首先在NCBI数据库中获取抗原的氨基酸序列,然后使用BLAST并与人类蛋白进行同源比对;之后使用Ne

【作者】

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王心倩孙妍占卫红雷航陈高瞻余晓丽

【机构】

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武汉轻工大学生物与制药工程学院

【出处】

：

武汉轻工大学学报

【发表日期】

：

2016年2期

【关键词】

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结核分枝杆菌 Rv3607c T细胞表位分析 Mycobacterium tuberculosis Rv3607c T cell epitope analy

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为了预测和分析结核分枝杆菌（MTB）Rv3607c抗原的CD4＋T以及CD8＋T细胞表位的分布状况,首先在NCBI数据库中获取抗原的氨基酸序列,然后使用BLAST并与人类蛋白进行同源比对;之后使用Net MHC数据库预测并分析MTB的Rv3607c抗原的CD4＋T细胞表位的分布状况;再使用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和Net MHC在线预测分析MTB的Rv3607c抗原CD8＋T细胞表位的分布状况。结合两个表位预测结果,筛选出最终表位肽段,为后续验证试验做准备。其结果为：首先预测出MTB的

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