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用分子自动机模拟电子计算机是DNA计算领域内的重要内容,该文在对已有的模型进行分析的基础上,提出了模拟有穷自动机的分子自动机模型.在能读出转移路径的分子自动机模型中,巧妙地运用了酶HgaI的作用.在结果链中,如果能提出完整的双链分子,则从该链上能读出该分子自动机识别的字符串和转移路径.此外,将复杂的自动机分成了几个简单的自动机,从而减小了分子链因过长而破裂的概率.在此基础上提出了通讯自动机的思想.最后,对该自动机识别的语言进行了说明.