【摘 要】
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本研究利用相关生物信息学软件和数据库对牦牛miR-101进行了靶基因预测与生物信息学分析。通过高通量测序获取牦牛miR-101的序列,并分析其序列保守性;选取TargetScan、miRand
【机 构】
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中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育重点实验室,甘肃农业大学
【基金项目】
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现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-38);中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP-2014-LIHPS-01)
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本研究利用相关生物信息学软件和数据库对牦牛miR-101进行了靶基因预测与生物信息学分析。通过高通量测序获取牦牛miR-101的序列,并分析其序列保守性;选取TargetScan、miRanda、PicTar预测结果的交集并结合miRTarbase中已证实的靶基因集合,取二者并集,采用BINGO和DAVID数据库获得靶基因集合的本体注释,进行GO功能富集及Pathway信号通路富集分析。结果显示,miR-101序列在各物种间高度保守,miR-101调控的靶基因GO功能富集主要包括多细胞生物体发育、发育过程
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