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以四川中部三大名优酒厂所取20年窖龄的窖底泥，以及在安徽某酒厂所取窖龄为20年的老熟、未老化和老化窖泥为研究对象。通过PCR—DGGE技术及QuantityOne软件分析比对了各酒厂窖底泥的微生物群落结构。结果表明，与安徽某酒厂相比，四川3个酒厂的细菌群落结构极为相似，而各酒厂古菌菌群的差异较大；安徽某酒厂老化窖泥与其老熟及未老化窖泥相比，细菌和古茵茵群在数量和丰度上都有所降低，但是都有明显的优势菌存在。