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采用扩增片段长度多态性技术（AFLP）对6个紫菜品系进行遗传差异性分析。结果表明，在42对引物中，有6对能得到重复性较好的多态性条带，共扩增出141条谱带，其中133条为多态性谱带，多态位点的比例达94．33％。基于引物扩增结果计算遗传相似性，结果显示不同紫菜品系间存在差异。UPGMA、NJ法聚类分析结果表明，条斑紫菜品系Y001和Y-L0602遗传相似系数高，聚为一类；条斑紫菜和坛紫菜遗传重组品系Y-H034和H-Y035聚为一类，之后与Y-I-1017品系聚集；坛紫菜H017品系与其他供试品系遗传距离