应用Ion Torrent PGM TM平台检测中国汉族124个身份鉴定SNPs

来源 :中国法医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tiancai9550
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目的:应用IonTorrent PGMTM测序平台检测中国汉族群体124个身份鉴定SNPs(individual identiifcation SNPs,IISNP)的多态性信息。方法采用Ion AmpliseqTM Library试剂盒对中国汉族130个无关个体样本及2个家系共8个个体的124个SNPs(90个常染色体SNPs和34个Y染色体SNPs)进行复合扩增,在Ion Torrent PGMTM测序平台上检测。结果中国汉族130个无关个体应得14148个SNP分型,其中软件给出分型结果14086个,正确14085个(99.9929%),分型偏倚1例(0.0071%)。软件未报SNP分型62例,需人工校正分析。在90个常染色体SNPs中,MP值最高为0.8173(rs740910),最低为0.3480(rs2831700),CMP为6.8984×10-34;DP值最高为0.6520(rs1355366),最低为0.1827(rs727811),CDP为0.9999999999999999999999999999999993102,高于22个STRs的CDP;PE值最高为0.2781(rs1058083),最低为0.0073(rs1024116), CPE为0.9999996167,低于22个STRs的CPE。在34个Y-SNPs中,72个中国汉族男性无关个体共观察到8种单倍型。家系样本分型结果未发现突变,均符合遗传规律。结论124个身份鉴定SNPs在中国汉族群体中具有良好的遗传多态性,是理想的个体识别遗传标记。IonTorrent PGMTM平台在法庭科学领域有较好的应用价值。
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