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高校科研经费管理过程中存在着项目负责人经费管理意识淡薄、科研经费使用不规范、科研经费管理制度与现实脱节、科研经费报销程序烦琐复杂等问题。建议应通过提高科研人员对科研经费管理的认识、完善科研经费预算编制管理、强化科研经费使用的监督管理、规范结余经费的后续管理、加强科研经费信息化管理等措施,来提升科研资金的使用效益。井冈山大学近年来努力进行科研经费管理的探索与实践,采取院校两级管理、项目负责人负责制、信息化管理和预算管理等措施,促进了学校科研工作的健康发展。