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众所周知，组蛋白赖氨酸甲基化在调控表观遗传学全基因组表达中起重要作用。针对不同的位点，甲基化与基因表达和沉默都有关系。例如，组蛋白H3赖氨酸4（histone H3 lysine4，H3K4）的甲基化，与基因的激活有关；而H3K27的甲基化与基因的沉默有关。此外，在哺乳动物基因组中三种不同甲基化状态（reel、me2、me3）的分布特点及功能既有相似也有不同，而甲基转移酶及去甲基酶可以可逆性调节组蛋白甲基化。