元胡的根际细菌群落组成及种源差异

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  摘要:目的:分析元胡的根际细菌多样性及组成,以探究元胡根际微生物组成与种源的关系。方法:选取6个种源的元胡种植在道地产区同一类型土壤中,在收获期采集元胡根际土,利用Miseq测序检测根际细菌群落,并分析其种源差异。结果:不同种源之间元胡根际细菌多样性水平整体差异不大,细菌的结构在门水平也无显著性差异,均由变形菌、酸杆菌、放线菌、厚壁菌、拟杆菌门、疣微菌和芽单胞菌等组成。道地性产区中,所有种源的元胡根际优势菌基本相同,均含有Gp16,Saccharibacteria等优势菌,劣势菌有一定差异。PCoA主成分分析显示,6个种源间距离相当,均没有体现差异性。结论:元胡细菌群落的组成无种源差异,种源与土壤类型、气候等因素共同决定元胡根际细菌多样性组成。
  关键词:元胡;道地性;土壤细菌群落;Miseq测序
  中图分类号:S56
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