为初步探讨扁桃内果皮薄厚差异形成的机理及MYB46转录因子基因在扁桃内果皮木质素生物合成途径中的作用,本研究以薄壳‘纸皮’和厚壳‘长石头’2个扁桃品种为供试材料,测定内果皮厚度和木质素含量并分析两者的关系。利用RT-PCR结合RACE技术克隆MYB46转录因子基因,并利用实时荧光定量PCR技术分析其表达模式。序列分析结果表明,AcMYB46-z和AcMYB46-c基因全长均为1 380 bp,ORF均为1 017 bp,均编码338个氨基酸,蛋白的相对分子质量分别为37.36和38.77 kDa。推测AcMYB46-z和AcMYB46-c氨基酸序列N端均含有2个高度保守结构域SANT,表明其均属于R2R3类转录因子。系统进化树分析结果AcMYB46-z和AcMYB46-c分别与桃、梅聚为一类。通过qRT-PCR技术对MYB46转录因子基因的时空表达模式进行研究,发现在2个扁桃品种各个发育时期均有表达。相关性分析结果表明,2个扁桃品种的内果皮厚度与木质素含量均呈极显著正相关。推测MYB46转录因子基因参与调控扁桃内果皮木质素的代谢。