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精子RNA量少,但种类多。由于生物技术的发展,多种精子RNA的功能和机制被阐明。微小RNA （miRNAs）和mRNA影响精子形成过程中的染色体固缩、鞭毛结构与动力;与Piwi蛋白相作用的RNA（piRNAs）抑制反转录转座子活性、维持基因组稳定,但作用有限。受精和早期胚胎发育过程中,m RNA调节细胞能量通路、影响配子功能（如核质运输和有丝分裂）;miRNAs和内源性小片段干扰RNA（endo-siRNAs）的缺失会使胚胎早期发育产生异常;部分miRNAs前体（pri-mir-RNAs）以前体形式运输,