【摘 要】
:
目的了解四川省2011—2017年间狂犬病病毒(rabies virus,RABV)株的分子特征以及流行株与疫苗株在核酸、氨基酸和蛋白修饰水平上的差异。方法对采集于2011—2017年间的23份RABV抗原阳性犬脑组织标本,通过RT-PCR以特异性引物扩增病毒核蛋白(nucleoprotein,N)基因和糖蛋白(glycoprotein,G)基因并测序,通过生物信息学软件分别对N基因和G基因进行基
【机 构】
:
四川省疾病预防控制中心,成都 610041,四川省疾病预防控制中心,成都 610041,四川省疾病预防控制中心,成都 610041,四川省疾病预防控制中心,成都 610041,四川省疾病预防控制中心,
论文部分内容阅读
目的了解四川省2011—2017年间狂犬病病毒(rabies virus,RABV)株的分子特征以及流行株与疫苗株在核酸、氨基酸和蛋白修饰水平上的差异。
方法对采集于2011—2017年间的23份RABV抗原阳性犬脑组织标本,通过RT-PCR以特异性引物扩增病毒核蛋白(nucleoprotein,N)基因和糖蛋白(glycoprotein,G)基因并测序,通过生物信息学软件分别对N基因和G基因进行基因特征分析。
结果对23株RABV(简称四川株)N、G基因测序获得的全序列遗传进化关系分析表明,四川株均为rabies virus种,可分为3个进化分支且具有明显的地域特征,部分四川株与我国东部和北方流行毒株共循环。四川株间N基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.4%~100%和99.6%~100%,与参考株N基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为72.1%~99.8%和81.6%~100%。四川株与疫苗株相比在抗原位点、细胞表位以及信号肽序列上有一定差异,但主要抗原性、组织嗜性和毒力没有改变。
结论四川株间无明显差异,均为rabies virus种。四川株与疫苗株病毒糖蛋白的氨基酸序列存在不同程度的差异,但毒力未发生改变。
其他文献
目的分析2014—2016年吉林省婴幼儿腹泻患者中诺如病毒(Norovirus,NoV)的基因特征。方法本研究采集2014年1月至2016年12月吉林省小于5岁腹泻住院婴幼儿标本,采用RT-PCR方法将标本进行扩增,对阳性产物进行聚合酶区和衣壳区序列测定,构建系统进化树。结果收集粪便标本共1 335份,阳性总数为177份,阳性率为13.26%(177/1 335)。其中,2014年阳性率为11.8
HIV-1病毒蛋白R(Viral Protein R,Vpr)是HIV-1的辅助蛋白,可以增加HIV-1的感染性,激活潜伏期病毒,并可以协同其他辅助蛋白的功能。多项研究已经证明了Vpr在HIV-1相关神经系统疾病发病机制中的重要作用,Vpr可以破坏血脑屏障的完整性,诱导神经细胞凋亡,并且可能是艾滋病痴呆综合征(AIDS dementia complex,ADC)发生和发展的重要致病因子,但是其确切
目的观察LC3、LC3-II/LC3-I比值、Nrf2和Bcl2在柯萨奇病毒B组3型(coxsackievirus group B tyype 3, CV-B3)感染后引起的心肌炎和4种不同污染源气体颗粒物滴入气管后引起的SD大鼠心肌损害的不同变化,来探讨这些病理条件下心肌细胞自噬与抗凋亡、抗心肌损害作用机制。方法将成年SD大鼠随机分为CV-B3感染组(20只)、汽车尾气组(20只)、煤烟组(20
目的采用无创性评价指标评估恩替卡韦(entecavir, ETV)抗病毒治疗过程中肝纤维化的动态变化。方法共纳入303例行肝穿活检的HBeAg阴性未治疗慢乙肝(chronic hepatitis B,CHB)患者,其中196例需抗病毒治疗且接受了至少3年ETV治疗,临床及病毒学评价在基线、1年、2年、3年后各进行一次。APRI评分被用来评估抗病毒治疗过程中肝纤维化程度的动态变化。结果根据METAV
目的以柯萨奇病毒B组4型(Coxsackievirus B4, CV-B4)VP1基因的原核表达蛋白作为包被抗原,建立并优化间接ELISA方法,用于CV-B4的抗体检测。方法采用RT-PCR技术扩增CV-B4病毒VP1基因,构建重组表达载体pET-32VP1,并转化至表达菌株大肠埃希菌Rosetta(DE3),进行IPTG诱导表达,经SDS-PAGE和蛋白质谱鉴定目的蛋白成功表达。以纯化的重组蛋白
长链非编码RNA(long non-coding RNA,IncRNA)在细胞生命活动中扮演着重要的角色,在病毒与宿主相互作用中也发挥多种调控作用。病毒的感染能诱导细胞内多种lncRNA的差异表达,而差异表达的lncRNA又可通过各种方式来对侵染的病毒起到或抑制或协助的作用。本文主要列举了不同种类的病毒所诱导的差异表达的lncRNA,以及病毒与这些lncRNA之间的相互作用机制。
目的观察鼻病毒16型感染H1-HeLa细胞后的细胞内源性siRNA变化。方法将鼻病毒16型感染H1-HeLa敏感细胞12 h、24 h、36 h后,利用高通量测序(二代测序)筛选出差异siRNA,再通过qRT-PCR方法进行验证。结果高通量测序分析鼻病毒感染的不同时间点均有差异性siRNA产生,其中novel_sir907和novel_sir1950在三个时间点均降低;进一步通过qRT-PCR验证
目的本研究旨在研究B型流感病毒Vero细胞适应株作为母本,遗传重配制备B型流感病毒Vero细胞适应株。方法选择WHO推荐2017—2018年疫苗株B/massa chusetts/2/2012(简称BX-51B)与实验室原有母本株B/Malaysia/2506/2004Va(简称Bv)共同感染鸡胚和Vero细胞,用抗Bv血清筛选重配病毒,空斑纯化筛选出含有流行株表面抗原的Vero细胞适应株。结果获
目的了解在新疆南部地区西尼罗病毒(west nile virus, WNV)感染的情况。方法于2012年在新疆南部地区采集发热患者和鸡血清标本,通过酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)及中和试验检测标本中西尼罗病毒特异性抗体。结果在新疆南部地区8个县共采集到门诊和住院患者1 712份血清标本,其中WNV IgM抗体阳性和WNV中和抗体阳
目的了解河北省儿童病毒性炎病原学特点。方法随机收集2017年5月2017年12月河北省儿童医院神经内科住院诊断为病毒性脑炎患儿的脑脊液样本399例,采用结合自动化工作站的实时荧光定量PCR方法和Sanger测序方法检测脑脊液中的病毒核酸。运用SPSS21.0统计分析软件结合临床资料进行分析。不同月份EV引起的脑炎的感染率比较,采用行×列表卡方检验法进行分析。不同病毒引起的脑炎患者的MRI和脑电图阳