【摘 要】
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棘腹蛙Paa boulengeri的遗传研究和基因组信息比较匮乏,致使可有效利用的分子标记非常有限。以棘腹蛙RNA-seq高通量测序数据为基础进行微卫星分子标记的大规模发掘和特征分析
【机 构】
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重庆文理学院林学与生命科学学院,重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心
【基金项目】
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重庆文理学院人才引进项目(R2014LX07,R2013LS13);重庆市前沿与应用基础研究(一般)项目(cstc2014jcyj A80042);重庆市科技攻关计划(cstc2012gg-yyjs80004)
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棘腹蛙Paa boulengeri的遗传研究和基因组信息比较匮乏,致使可有效利用的分子标记非常有限。以棘腹蛙RNA-seq高通量测序数据为基础进行微卫星分子标记的大规模发掘和特征分析,结果显示：在121.6 Mb的棘腹蛙转录组序列中发现微卫星位点3165个,包含于3034条Contig序列中。在筛选到的1~6碱基重复核心的微卫星中,单碱基重复核心的比例最高,之后为三碱基、二碱基、四碱基、六碱基和五碱基重复核心,分别占29.0%、25.2%、21.7%、10.0%、10.0%和3.0%。其中A/T、AC/G
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