血清3型鸭甲型肝炎病毒TaqMan RT-qPCR检测方法的建立及初步应用

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根据GenBank中已发布的血清3型鸭甲型肝炎病毒(DHAV-3)基因序列,针对VP1基因序列的保守区域设计一对引物及一条特异性TaqMan探针建立了DHAV-3的TaqMan荧光定量检测方法(TaqMan RT-qPCR)。通过对反应条件和反应体系的优化,建立的TaqMan RT-qPCR方法在6.39×10~8~6.39×10~0拷贝/μL范围内具有良好的线性关系,R2值为0.999。该方法能特异地检测出DHAV-3,与血清1型鸭甲型肝炎病毒(DHAV-1)及其他常见鸭病病原无交叉反应,且组内和组间重复性试验变异系数均小于1%。用普通RT-PCR方法和建立的TaqMan RT-qPCR方法,对63份临床疑似鸭肝炎的肝组织样品进行检测,结果 RT-PCR方法检出DHAV-3的阳性率是34.92%(22/63),TaqMan RT-qPCR方法检出的阳性率是41.27%(26/63);对49份DHAV-3感染康复鸭的肛拭子样品进行检测,RT-PCR和TaqMan RT-qPCR方法检出阳性率分别为22.45%(11/49)和85.71%(42/49);用TaqMan RT-qPCR方法和鸡胚半数致死量法(ELD50)对DHAV-3(SD70株)鸡胚病毒含量进行检测比较,两种方法检测结果呈正相关。结果表明所建立的TaqMan RT-qPCR检测方法特异性好,灵敏度高,为DHA-3快速诊断和流行病学调查提供技术手段。
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