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应用系统发育树分析DDBJ基因库中HBV基因序列的基因型

来源 :生物技术通讯 | 被引量 : 0次 | 上传用户：smilepk

【摘 要】

：

为了充分利用核酸库中的HBV序列信息,探讨DDBJ核酸库中HBV基因序列的基因分型,采用Clustal X(1.8)软件比较HBV基因序列前S区序列差异并产生系统发育树.通过对下载的1 471条HB

【作 者】

：

戴二黑 杨瑞馥 刘恒军 宋亚军 

【机 构】

：

石家庄市第五医院,军事医学科学院

【出 处】

：

生物技术通讯

【发表日期】

：

2003年1期

【关键词】

：

系统发育树分析 DDBJ基因库 HBV 基因序列 基因型 乙型肝炎病毒 hepatitis virus B genotype phylogenetic 

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为了充分利用核酸库中的HBV序列信息,探讨DDBJ核酸库中HBV基因序列的基因分型,采用Clustal X(1.8)软件比较HBV基因序列前S区序列差异并产生系统发育树.通过对下载的1 471条HBV基因序列进行系统分析,获得了228条前S/S区完整的HBV基因序列,其中有66条序列的基因型已被各种方法所证实.利用软件分析绘制了基于228条HBV前S区基因序列的系统发育树.66条已知基因型HBV基因序列在系统发育树上的分型与其原有基因型完全吻合.在228条HBV基因序列中,有207条序列分别属于A、B、C

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