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以螯虾次目功能基因组中的208个蛋白质编码基因序列为数据来源，应用CodonW 1.4软件对螯虾次目功能基因中密码子组成、同义密码子使用频率、密码子3个位置的G＋C含量、有效密码子数等进行分析。结果显示，螯虾次目密码子第三位的G＋C含量明显高于第一/二位，表现出对以G或C碱基结尾的密码子的偏好性使用，并确定了9个螯虾次目最优密码子。上述研究结果为今后螯虾次目新基因的发现、功能基因表达调控研究、蛋白质结构和功能预测、以及与其他虾类的比较基因组学研究、螯虾分子标记育种等提供了理论基础。