【摘 要】
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DNA测序过程中，每个碱基具有一个质量值，其值都会与合格质量有所偏差。为了保证测序的准确性，偏差过大的碱基须淘汰，于是原来100bp的DNA序列根据淘汰碱基的位置而缩短成若干序列
【基金项目】
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国家“863”高技术发展计划项目（2003AA001018）
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DNA测序过程中，每个碱基具有一个质量值，其值都会与合格质量有所偏差。为了保证测序的准确性，偏差过大的碱基须淘汰，于是原来100bp的DNA序列根据淘汰碱基的位置而缩短成若干序列片段了。最后选取其中最长的碱基片段，即DNA质量筛选。传统质量筛选算法虽然思路简单，但合格碱基过于分散。为了解决这一问题，上海生命科学院介绍了“滑窗算法”，能选取出60％以上的碱基片段，大大提高了碱基有效片段的长度。在此基础上，文中提出了“双侧变值滑窗算法”。经测试表明，文中算法能选取出70％以上的碱基片段，进一步提高了碱基片段有
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