细胞色素P450超家族4种蛋白质晶体结构比较研究

来源 :生物化学与生物物理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kgfu86
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通过二级结构特征比较、三维结构比较和疏水图分析阐明了4种P450晶体结构的保守性。尽管4种晶体蛋白的氨基酸序列等同率只有19%~26%,但是它们都有相同的13个α螺旋和β1~β4四个片层结构。以P450血红素辅基中卟啉环碳原子作为叠合点叠合4种晶体结构,由叠合结构推导出4种蛋白质基于结构的序列联配。通过计算晶体结构各二级结构Cα原子之间均方根偏差,分级类聚分析法分析,发现P450蛋白三维结构可分为结构非常保守区、结构较保守区、结构较不保守区和结构变化区,其中前两组结构特征区组成了P450蛋白内部结构,占总匹配残基的56.9%,该区域包括P450酶活性位点的重要组成部分。疏水图分析发现4种晶体结构的强亲水峰和强疏水峰出现在相同的匹配位置。P450晶体结构比较结果为P450超家族蛋白质基于结构的序列联配方法提供了依据。
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