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基于改进马尔可夫模型的启动子预测算法
基于改进马尔可夫模型的启动子预测算法
来源 :计算机工程与科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mysticlisten
【摘 要】
:
本文实现了基于马尔可夫模型的启动子预测算法,结合隐马尔可夫模型中的前向算法,改进了基于马尔可夫理论的启动子预测方法,具体改进了碱基转移概率的算法和序列所在模型的概率。
【作 者】
:
孔帆帆
李宏
李号双
尹翔
【机 构】
:
中南大学信息科学与工程学院,中南大学生物医学工程研究院
【出 处】
:
计算机工程与科学
【发表日期】
:
2007年12期
【关键词】
:
启动子识别
马尔可夫模型
前向算法
promoter identification Markov model forward algorithm
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本文实现了基于马尔可夫模型的启动子预测算法,结合隐马尔可夫模型中的前向算法,改进了基于马尔可夫理论的启动子预测方法,具体改进了碱基转移概率的算法和序列所在模型的概率。改进的马尔可夫模型的预测结果显示,以此模型建立的系统能更有效地识别数据集中的三种序列。
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