山杏CAT家族基因的生物信息学预测及表达分析

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CAT (Cationic amino acid transporters)作为一类跨膜转运蛋白,广泛参与植物体内氨基酸的吸收与转运.为了深入研究CAT家族基因在蛋白质累积过程中的调控作用,本研究以山杏(Prunus sibirica L.)果实为试材,以前期所获得的不同发育期山杏果实转录组测序数据为依据,通过功能注释与分析获得了6个CAT家族成员基因,分别命名为PsCA T1、PsCA T2、PsCA T5、PsCA T7、PsCA T8和PsCA T9.生物信息学分析结果表明,山杏果实PsCAT家族基因均含有完整的开放阅读框,可编码以α-螺旋二级结构为主、不含信号肽的非分泌蛋白,且含有多个磷酸化位点;除PsCAT2蛋白外,其余5个PsCAT蛋白均为碱性蛋白,而除了PsCAT5蛋白定位于线粒体外,其余均为内质网定位的强疏水性的跨膜转运蛋白.同时,采用qRT-PCR技术对PsCAT基因在不同发育山杏果实中的动态转录表达进行检测,结果发现,PsCA T2、PsCA T5和PsCA T7在30 DAF时表达量最高,而PsCA T1、PsCA T8和PsCA T9在60 DAF时表达量最高;另外,PsCA T2在不同发育山杏果实中的表达量均显著高于其它PsCAT基因,推测其可能在山杏果肉蛋白累积过程中起主导作用.研究结果可为后续研究山杏果肉蛋白的累积规律及调控机理提供科研依据,具有重要的学术价值.
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