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香菇（Lentinulaedodes）是世界主要栽培食用菌之一，香菇菌种的准确鉴定是香菇大规模生产和菌种知识产权保护的重要前提。本研究基于香菇全基因组序列开发200对SSR标记用于25份常用香菇栽培菌种的遗传多样性分析和菌种鉴定。结果表明：供试材料的遗传相似性较高，遗传相似系数平均值为0．776，最小值为0．567，最大值为1。基于遗传多样性分析结果，筛选出7对带型清晰且重复性好的SSR标记，并成功构建了11份香菇商业菌种的多位点SSR指纹图谱。这11份菌种分别为：cr．02、闵丰1号、香菇241．4、森