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消化道恶性肿瘤在所有恶性肿瘤的发病和死亡率中占据前列，我国约有超过57％的恶性肿瘤均为消化道恶性肿瘤，其中部分消化道恶性肿瘤如肝癌、胰腺癌和胆囊癌的预后非常差。近年来消化道恶性肿瘤的诊治虽然取得了长足的进展，但不同患者间存在着显著的疗效差异和毒性不良反应。除了环境等因素外，不同个体的基因组差异也是造成药物效应差异的主要因素，消化道恶性肿瘤治疗方法的发展在很大程度上取决于药物基因组学的研究与应用。