目的:探讨核苷类药物和干扰素对不同基因乙型肝炎的疗效差异。方法:对431例乙型肝炎患者行基因分型和基因突变检测,根据用药分为干扰素组(n=216)和核苷类组(n=215),比较两组患者治疗48周后的效果及治疗应答率的差异。结果:HBV-B型者292例(67.75%),HBV-C型者139例(32.25%);原发性耐药基因突变患者13例,继发性耐药基因位点突变63例。治疗48周后,核苷类组患者丙氨酸氨基转移酶(ALT)复常率、HBV-DNA转阴率高于干扰素组(P<0.01),HBe Ag转阴率、HBe Ag转换率低于干扰素组(均P<0.05);核苷类组中HBV-B与HBV-C型患者的治疗应答率差异无统计学意义(P>0.05);原发性突变、继发性突变和未突变患者之间治疗应答率差异有统计学意义(P<0.01)。干扰素组中HBV-B患者治疗应答率明显高于HBV-C患者(P<0.05);在原发性突变、继发性突变和未突变患者之间治疗应答率差异无统计学意义(P>0.05)。结论:治疗乙型肝炎需要根据患者基因分型和基因突变情况合理选择药物;同时还要对耐药基因进行监测,当出现基因突变产生耐药时要尽快调整治疗方案,以获得最佳的治疗效果。