【摘 要】
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目的通过分析一株临床耐药菌高通量测序的数据,探讨从二代测序原始数据中挖掘提取有用信息的流程。方法综合利用主流生物信息学软件,筛选可能和耐药有关的突变位点。结果通过
【机 构】
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江苏大学医学部,镇江市丹徒区中医院,南京市高淳人民医院
【基金项目】
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镇江市丹徒区社会发展项目(SH20160103),江苏大学医学临床科技发展基金(JLY20160222).
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目的通过分析一株临床耐药菌高通量测序的数据,探讨从二代测序原始数据中挖掘提取有用信息的流程。方法综合利用主流生物信息学软件,筛选可能和耐药有关的突变位点。结果通过对基因组测序数据的处理和从头组装,得到该菌株基因组的基本特征、进化关系及可能和抗药性有关的突变位点。结论随着高通量测序技术的发展,临床分离出的致病菌的测序已经成了常规的研究技术。通过对测序数据的深度挖掘,将为临床研究致病菌的致病和耐药机制提供更有价值的线索。
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