【摘 要】
：
依据基因组中的单核苷酸多态性(SNPs)位点对不同来源家蚕核型多角体病毒(BmNPV)进行地理株系溯源,有利于BmNPV的分子流行病学研究以及对病害流行的预防性控制.采用霰弹法对Bm
【机 构】
：
家蚕基因组生物学国家重点实验室,西南大学,重庆400715;农业部蚕桑学重点开放实验室,重庆400715;农业部蚕桑学重点开放实验室,重庆,400715;重庆师范大学生命科学学院,重庆400026
论文部分内容阅读
依据基因组中的单核苷酸多态性(SNPs)位点对不同来源家蚕核型多角体病毒(BmNPV)进行地理株系溯源,有利于BmNPV的分子流行病学研究以及对病害流行的预防性控制.采用霰弹法对BmNPV重庆分离株CQ1进行全基因组测序,获得了1052条reads序列,测序深度为3.5倍,覆盖基因组95％以上的区域.采用生物信息学方法,将这些序列与BmNPV日本分离株T3的基因组序列进行比对分析,在2个株系间共鉴定获得400个候选SNPs.与T3株基因组唯一位点匹配的386个SNPs中,有77％的SNPs属于转换,23％的SNPs属于颠换;15个SNPs位于基因间区,其余都分布在基因编码区;115个非同义SNPs(cSNPs)分布于67个基因的编码序列中,其中11个基因有至少3个非同义SNPs,例如CQ1分离株的非必需基因orf74有5个非同义SNPs.结构预测显示,CQ1分离株的几丁质酶基因中3个非同义SNPs引起变化的氨基酸位点均位于几丁质酶的三维结构表面.研究结果表明,BmNPV CQ1和BmNPV T3株系之间存在丰富的单核苷酸多态性.
其他文献
以筛选得到的Schizochytrium sp.(裂殖弧菌)作为研究对象，考察了合成培养基中维生素对该菌株高密度培养过程中生物量的影响，优化了适合Schizochytrium sp.高密度生长的维生素组
调查与分析桑园在冬季增施蚕沙有机肥和全年单施化肥对土壤中5种重要酶的活性以及桑叶产量和品质的影响,为蚕沙有机肥的应用提供试验依据.两种施肥方案使桑园土壤中的5种重要
枝、叶的性状及二者间的关系是植物生态学研究的重要内容之一.采用雾化栽培技术控制环境变化,以桑品种农桑14号的2年生实生苗供试,研究遗传背景下新生桑枝的枝条和叶片性状之
MoS2二维纳米材料的应用越来越广泛,因此对其生物效应的评估变得尤为重要.给家蚕添食不同浓度的MoS2二维纳米片,研究其对家蚕生长及蚕丝力学性能和结构的影响.结果 表明,当Mo
铁路作为交通领域中较为重要的一个行业,其发展是值得专业人士重视的。随着科技的不断进步,无线通信技术在铁路运输中的应用也越来越广,它使得铁路生产成本降低,而且还是的运
研究了pH、温度和盐类对不同体系中ε-聚赖氨酸(ε-PL)稳定性及抑菌活性的影响。结果表明，ε-PL在含菌成熟发酵醪和除菌发酵液中，酸性条件下，比较稳定；而在碱性条件下，其会逐渐降
本文从工程实践的角度分析发酵生产过程的控制机理以及采用计算机自动控制技术对工业化大生产的发酵过程进行技术改造的实用技术。
对家蚕丝素蛋白的氨基酸组成、食用营养价值,以及经酶处理的消化产物的体外抗氧化活性进行测试分析,为开发高附加值丝素蛋白产品提供理论依据.测定结果表明,甘氨酸和丙氨酸是
本文测定ε-聚赖氨酸对不同白色链霉菌的最低抑制浓度，通过白色链霉菌中ε-聚赖氨酸降解酶的研究。进一步验证了ε-聚赖氨酸产生菌的ε-聚赖氨酸降解酶主要存在于膜上，同时发现
以啤酒糟为主要原料，经多种微生物液固态混合发酵，研制出复合酶蛋白饲料。饲料中粗蛋白含量从啤酒糟的20.2％提高到31.2％，粗纤维含量由22.7％降低到11.2％，且含有多种消化酶。