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[目的]本文旨在探究茅苍术二倍体与同源四倍体基因表达谱差异情况,为关键调控基因定位及基因工程育种等提供参考。[方法]以二倍体及其同源四倍体茅苍术为材料,比较两者的叶绿素、可溶性糖、可溶性蛋白及淀粉含量等生理指标,并进行转录组测序分析。[结果]茅苍术同源四倍体叶片和茎的可溶性糖、可溶性蛋白及可溶性淀粉含量均显著高于二倍体。转录组测序结果共得到差异表达基因(DEG)4446个,其中上调DEG为3066个,下调DEG为1380个;共有4446个差异表达基因注释到GO功能库的生物进程、细胞组分与分子功能3大功能区