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中西医学受到其自身自然哲学中宇宙生成论的影响，对疾病和人的进化有着完全不同的认知。朱熹的理学总汇宋代理学之大成，其关于宇宙生成与演化的学说很值得研究，在历史上对中医学发展有诸多启沃；西方近代的的宇宙生成论则以康德为代表。而两者均汲取了当时最先进的科技成果，但在认知论上的差异很大。在对人的进化与生命现象的诠释和阐发方面，现代哲学家波普尔独有见地；而中医学理论之于脑为泥丸、髓海等学说，以及人体直立的原因与任督两脉的研究颇引人深思。