2020年河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子流行病学调查及ORF5基因变异分析

来源 :河南农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tianyemin
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为了解河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行及变异情况,对2020年采集于河南省401份PRRSV感染疑似病料进行TaqMan荧光定量PCR(FQ-PCR)检测。结果共检测出100份阳性样品,阳性率为24.9%;对其中18株PRRSV流行毒株ORF5基因进行测序、同源性比对和遗传进化分析。同源性比对结果显示,18株PRRSV流行毒株ORF5基因核苷酸序列同源性83.4%以上,与参考毒株同源性为82.9%~99.7%。遗传进化结果显示,18株PRRSV流行毒株序列均为美洲株,分属于1、5、8三个谱系,其中2株分属于以JXAl为代表的的谱系8,1株分属于以VR2332为代表的谱系5,15株分属于以NADC30为代表的谱系1。氨基酸比对结果显示,HN-TH1、HY-PY1、HN-XY1毒株的13位以及HN-XC1毒株的151位氨基酸毒力相关位点发生了不同程度的突变。
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