运用SNP芯片评估马身猪保种群体的遗传结构

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lewllen

【摘要】

：

旨在研究马身猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系和家系结构。本研究利用Illumina CAUPorince 50 K SNP芯片检测39头保种马身猪的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorph

【作者】

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蔡春波张雪莲张万峰杨阳高鹏飞郭晓红李步高曹果清

【机构】

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山西农业大学动物科学学院

【出处】

：

畜牧兽医学报

【发表日期】

：

2021年4期

【关键词】

：

马身猪保种群体 SNP芯片遗传多样性亲缘关系家系结构 Mashen pig conserved population SNP chip ge

【基金项目】

：

三晋学者支持计划专项经费(2016,2017),国家自然科学基金(31872336),山西省“1331”工程(J201811301),山西省青年基金(201901D211376),山西省优秀博士奖励(SXYBKY2018012),山西农业大学科技创新(2018YJ35)

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旨在研究马身猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系和家系结构。本研究利用Illumina CAUPorince 50 K SNP芯片检测39头保种马身猪的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP);采用Plink软件计算最小等位基因频率、多态信息含量、观察杂合度和期望杂合度,分析保种群体的遗传多样性;采用Plink软件构建状态同源(identity by state, IBS)距离矩阵和分析连续性纯合片段(runs of homozygosity, ROH),采用G

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