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在传统主成分分析方法的基础上，以作战效能为目标、以评定目标为导向，对某水下航行器总体方案决策问题进行了研究，分析了影响因素与决策目标以及影响因素之间的关系，并对指标进行标准化处理，提高了评定的可信性。评定结果与传统方法评定结果一致，证实了该方法的有效性。同时，从得到的主成分数学表达式的系数正负符号分析可知，相对于传统方法本文方法更准确地反映了方案的真实情况，表明了其合理性。