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【目的】探究4l份苹果属内种质资源类型的亲缘关系，验证以往亲缘关系分类，补充传统分类学的不足。【方法】利用AFLP技术，通过DNA提取、酶切连接、预扩增、选择性扩增、引物选择、数据分析等，对41份苹果属内种质资源类型进行亲缘关系分析。【结果】从64对引物中筛选出11对多态性较好的引物，11对引物平均多态率为86．72％。UPGMA聚类结果显示，41份供试材料的遗传相似系数为0．5754-1．0000，并在0．755处将41份种质分为6大类群，揭示了它们之间的亲缘关系，大部分种质的分类结果与传统的分类方法一