【摘 要】
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目的 采用生物信息学方法预测PD-L1蛋白的结构及功能.方法 在UniProt数据库中获取人PD-L1蛋白的氨基酸序列;运用ProtParam及ProtScale预测人PD-L1蛋白的理化性质及亲疏水性;应用TMHMM分析人PD-L1蛋白的跨膜区;分别利用SOPMA及Swiss-Model分析人PD-L1蛋白的二级结构并建立三级结构模型;利用STRING、蛋白同源性预测网站及信号肽预测服务器预测与人PD-L1蛋白相互作用蛋白、PD-L1蛋白的同源性以及是否有信号肽.结果 人PD-L1蛋白有290个氨基酸,
【机 构】
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重庆市渝北区中医院骨伤科,重庆 401120;重庆市渝北区人民医院放射科,重庆 401120
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目的 采用生物信息学方法预测PD-L1蛋白的结构及功能.方法 在UniProt数据库中获取人PD-L1蛋白的氨基酸序列;运用ProtParam及ProtScale预测人PD-L1蛋白的理化性质及亲疏水性;应用TMHMM分析人PD-L1蛋白的跨膜区;分别利用SOPMA及Swiss-Model分析人PD-L1蛋白的二级结构并建立三级结构模型;利用STRING、蛋白同源性预测网站及信号肽预测服务器预测与人PD-L1蛋白相互作用蛋白、PD-L1蛋白的同源性以及是否有信号肽.结果 人PD-L1蛋白有290个氨基酸,等电点为6.76,有信号肽,蛋白质具亲水性且高度保守;二级结构推测无规则卷曲是人PD-L1蛋白最大量的二级结构原件,而α-螺旋和延伸链散布于整个蛋白中;Swiss-Model预测了5种三级结构模型;人PD-L1蛋白的相互作用蛋白可能参与并影响细胞信号转导功能.结论 人PD-L1蛋白是PD-1的关键配体蛋白,生物信息学预测其属跨膜蛋白,其对肿瘤的发生、发展以及免疫细胞的功能具有重要影响.
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