长白县黑线姬鼠携带汉坦病毒的S基因特征研究

来源 :病毒学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wumingwuming2009
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为了解长白县黑线姬鼠中汉坦病毒流行情况及病毒型别,采用巢式RT-PCR方法筛查鼠肺RNA,并对PCR阳性样本进行全S基因的扩增、克隆及测序;构建系统发生树并进行分子进化分析.结果显示:共捕获黑线姬鼠58只,共检测出4份阳性标本,阳性率6.90%.经过序列测定及进化分析显示黑线姬鼠所携带的病毒与汉滩病毒第6基因亚型标准株核苷酸的同源性为95.8%~96.3%,氨基酸同源性为98.6%~99.5%.同时发现,长白县黑线姬鼠携带的汉滩病毒的NP蛋白共有1个特异性氨基酸位点为S387.
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