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本文对登革2型病毒国内分离株（D2-04）主要非结构蛋白NS1编码基因的核苷酸序列及氨基酸序列进行分析。结果表明D2-04株NS1基因含有1056个核苷酸，编码一个352个氨基酸的多肽。核苷酸序列的碱基组成为33.6%A，20.6%C，24.5%G，21.2%U。全长序列含两个糖基化位点，分别于氨基酸残基130和207位；一个可能的蛋白裂解位点350～352、含12个保守的半胱氨酸残基，其中5个集中在280～330的保守区内。D3-04株NS1编码区的核苷酸序列与文献报道的登革2型几内亚C株，牙买加株，候选疫苗株以及马来西亚当地流行株比较，同源性分别为90.8、93.5、89.4、87.8%与登革1型同源性为69.4%，与登革4型同源性为67.1%。氨基酸序列的类似性与几内亚C株，牙买加株，候选疫苗株以及马来西亚株、DEN-1，DEN-4分别为92.3、93.4、92.890.6、70.5和69%。氨基酸序列的类似性与核苷酸序列的同源性基本上是一致的。但氨基酸的变化水平低于核苷酸的变化。